De la colaboración entre la ciencia y la industria ha surgido un método innovador para combatir las enfermedades de los cultivos utilizando bacterias locales beneficiosas del suelo.
Un equipo de científicos del Centro John Innes (Reino Unido) aisló y probó cientos de cepas de bacterias Pseudomonas del suelo recolectado en granjas y luego secuenció los genomas de 69 de ellas.
Al comparar los genomas de aquellas cepas que inhiben la actividad de los patógenos con aquellas que no lo hacen, el equipo pudo identificar un mecanismo clave para proteger el cultivo de papa de bacterias dañinas.
Luego, usando una combinación de química y genética y una serie de experimentos, los científicos demostraron que la producción de pequeñas moléculas llamadas lipopéptidos cíclicos es importante para controlar la sarna de la papa (una enfermedad bacteriana que causa un daño significativo al cultivo de papa). Estas pequeñas moléculas tienen un efecto antibacteriano sobre las bacterias patógenas que causan la sarna y ayudan a las bacterias beneficiosas Pseudomonas a migrar y colonizar las raíces de las plantas.
Los experimentos también han demostrado que el riego provoca cambios significativos en la población genéticamente diversa de Pseudomonas en el suelo.
El estudio, publicado en eLife, ofrece un método mediante el cual los científicos pueden estudiar el microbioma de prácticamente cualquier área de un campo y tener en cuenta diferentes condiciones de suelo, agroquímicos y ambientales.
Utilizando los avances en la secuenciación genética de alta velocidad, los científicos pueden analizar el microbioma del suelo en busca de bacterias beneficiosas y determinar qué moléculas se producen para suprimir los patógenos. El siguiente paso es propagar y devolver microorganismos beneficiosos al mismo campo.
Las aplicaciones potenciales para los potenciadores del microbioma incluyen la aplicación de cócteles bacterianos a la superficie de los tubérculos como un rocío o directamente en el suelo mediante riego por goteo.